Base de données en ligne – The Human Protein Atlas :

exemple de base de données en ligne

Un ensemble d'activités intégrant le HPA (Human Protein Atlas), une base de données en ligne consacrée aux protéines humaines. Les activités possibles peuvent se décliner à différents niveaux permettant de réinvestir l’utilisation de la base de données de la prise en main vers l’autonomie tout au long des classes du lycée notamment.

Point info : Présentation de la base de données. Le Human Protein Atlas est une base de données suédoise visant à fournir des informations diverses sur les protéines humaines dans les cellules, les tissus et les organes en s’appuyant sur différentes technologies (génomique, transcriptomique, protéomique et métabolomique) qui caractérisent et quantifient les protéines et les molécules qui leurs sont liées dans l’espèce humaine. Cette base de données permet une exploration du protéome humain via un site internet.  Le Human Protein Atlas est constitué de douze sections spécialisées chacune dans un aspect de l’analyse des protéines humaines. Les informations à disposition peuvent permettre de construire une diversité d'activités en classe  pour construire des compétences de manipulation de bases de données et éprouver leurs limites.

 

Exploiter Human Protein Atlas en classe :

Niveau Prise en main :
Exemple 1 : Expression des gènes en seconde, Spécialisation des cellules (2de)
Activité :  L’expression des gènes dans les cellules humaines

Exemple 2 : L’expression de l’information génétique (1^ère Spécialité SVT)
Activité : Caractériser différents gènes, Rechercher les cellules exprimant certaines protéines étudiées en classe

Exemple 3 : Une base de données histologiques (tous niveaux)
Activité : Découverte de la structure histologique de différents organes

Niveau Consolidation :
Exemple 4 : Localisation des gènes (1^ère ou Terminale Spécialité SVT)
Activité : Cartographier les gènes

Exemple 5 : Recherche de cellules exprimant des gènes (1^ère Spécialité SVT)
Activité : Production des enzymes digestives par différents organes

Niveau Autonomie :
Exemple 6 : Caractéristiques d’expression des organes (1^ère Spécialité SVT)
Activité : La double fonction du pancréas

Exemple 7 : L’expression des gènes dans des cellules spécialisées (1^ère ou Terminale Spécialité SVT)
Une diversité d'activités permettant la mise en place et le réinvestissement des compétences d'utilisation de la base de données dans différents contextes.

• Cas 1 : Expression du gène de la CFTR et mucoviscidose
• Cas 2 : Expression de l’ATP synthase (ubiquiste)
• Cas 3 : Expression de l'insuline, du glucagon et de leurs récepteur