Cet article fait partie d'un ensemble de ressources élaborées par l'académie de Strasbourg pour Enseigner avec le numérique, proposant des articles sur :
Un article d'introduction et de présentation de ce dossier est disponible ici : Introduction à l'utilisation du numérique en SVT
L'ATP synthase (Terminale spécialité)
Thème pédagogique : L’origine de l'ATP
Niveau : Terminale spécialité SVT
Partie du Programme : L’énergie est apportée sous forme de molécules d’ATP à toutes les cellules. Il n’y a pas de stockage de l’ATP, cette molécule est produite par les cellules à partir de matière organique, notamment le glucose. ... Des réactions conduisent à la production d’ATP qui permet les activités cellulaires.
Activité : Rechercher les cellules exprimant certaines protéines étudiées en classe : l'ATP synthase.
La base de données permet de rechercher les cellules exprimant certains gènes et donc de repérer les cellules spécialisées dans une fonction donnée. Les activités proposées permettent de montrer que certaines protéines sont exprimées dans un grand nombre de cellules, voire toutes alors que d’autres sont d’expressions beaucoup plus limitées ce qui permet de repérer des molécules dont le fonctionnement se fait dans de nombreuses cellules. Ainsi il est possible dans le cas d'une maladie génétique d'identifier quelles sont les cellules exprimant le gène et qui seront donc potentiellement affectés par la maladie.
Mise en situation et problématique :
On cherche à identifier, à partir d’une banque de données en ligne, les cellules exprimant l’ATP synthase.
L’ATP synthase est une enzyme mitochondriale constituée de nombreuses sous unités dont certains gènes sont cités ici :
ATP5F1A, ATP5F1B, ATP5F1C, ATP5F1D, ATP5PF, ...
Aide à la réalisation :
Utiliser le profil d’expression des gènes : Onglet TISSUE \ RNA AND PROTEIN EXPRESSION SUMMARY
Utiliser les résultats d'immunomarquage pour différents organes
Eléments de réponse :
Profil d'expression du gène ATP5F1A :
Profil d'expression en histogramme
Représentation variée de l'expression du gène.
Détection de la protéine CFTR par immunomarquage
Tableau - Comparaison de l’expression du gène CFTR par immunomarquage dans différents organes :
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La coloration brune indique la fixation d’un anticorps spécifique de la protéine exprimée par le gène étudié. |
| Muscle | Foie | |
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Echelle : 1,2 mm soit 1 200 µm |
| Cerveau | Rein |
Les gènes de l'ATP synthase sont exprimés dans la plupart des cellules. Cet enzyme est présente dans l'essentiel des cellules et participe dans les mitochondries à la production d'ATP.