Exemple de prise en main du logiciel NetBioDyn

Collège / Lycée Seconde (découverte, modèle « tout prêt »)

Au préalable les élèves ont réfléchi à ce qu’ils voudraient modéliser mais ne produisent pas l’environnement du modèle.

 Partie du Programme : 2^nde Corps Humain et Santé

Microbiote humain et santé :

La composition en microorganismes et la diversité du microbiote sont des indicateurs de santé. Habitudes alimentaires et évolution du microbiote. Compétition entre microbes.

1. Télécharger le Logiciel : http://tice.svt.free.fr/spip.php?article2122
   
   
   
   
   
2. Télécharger l’environnement du modèle : http://acces.ens-lyon.fr/acces/thematiques/immunite-et-vaccination/ressources-logicielles/college/un-modele-de-microbiote-intestinal-1/microbiote-intestinal-description-du-modele-numerique
   
   
   
   
3. Ouvrir NetBioDyn 
   
   
4. Ouvrir l’environnement
   
   
   
   
   
   
5. Relever les valeurs des différentes entités au temps 0

6. Modéliser l’effet de notre alimentation sur le microbiote

   1. Avec l’environnement de base : nutriment : 60 unités
      
      
      
   2. Avec une modification de l’environnement de base : nutriment : 30 unités
      
      
      
      
7. Modéliser l’effet de la composition du microbiote sur le développement de bactéries pathogènes
   
   
   1. Commencer la modélisation avec les paramétrages de base pendant 300 Tics, puis ajouter 10 bactéries pathogènes.
      
      
      
   2. Recommencer la modélisation avec un paramétrage réduisant d’environ moitié l’effectif de chaque espèce de bactérie.
      
      
      
      
      
      
8. Modéliser l’effet des antibiotiques sur notre microbiote
   
   Garder les paramétrages de base jusqu’à 300 Tics puis ajouter des antibiotiques répartis de manière homogène le long de l’intestin (80 unités)