Cet article fait partie d'un ensemble de ressources élaborées par l'académie de Strasbourg pour Enseigner avec le numérique, proposant des articles sur :
Un article d'introduction et de présentation de ce dossier est disponible ici : Introduction à l'utilisation du numérique en SVT
La taille de l'ADN dans les cellules (1ère spécialité)
Articulation de plusieurs bases de données pour une approche quantitative de la taille de l'ADN présente dans l'organisme humain.
Thème pédagogique : La réplication de l'ADN
Niveau : Première spécialité SVT
Partie du Programme :
Connaissance :
Chaque chromatide est constituée d'une longue molécule d'ADN associée à des protéines structurantes.
Capacités :
Calculer la longueur totale d’une molécule d’ADN dans un chromosome et de l’ensemble de l’ADN d’une cellule humaine ; comparer avec le diamètre d’une cellule. Calculer la longueur d’ADN de l’ensemble des cellules humaines.
Articulation de plusieurs banques de données
Une démarche en 3 étapes qui combine plusieurs bases de données :
- Protein Data Bank (rcsb) & Libmol (base de données de modèles moléculaires & visualisateur),
- NBCI genome ou genome data viewer (base de données de séquences génétiques),
- et Human cell tree map (base de données cellulaires).
L'articulation de plusieurs bases de données permet une approche quantitative de la taille de l'ADN présente dans l'organisme humain.
L'exploitation des activités peut se faire soit de manière linéaire mais peut également se prêter à une organisation par atelier ou à une approche collaborative. Elle permet de construire plusieurs scenarii pédagogiques selon les objectifs et les contraintes à prendre en compte.
Activités à tiroirs articulant différentes bases de données, mesures et calculs.
Un élargissement à partir des mesures faites à partir d'observations microscopiques est envisageable.
1. Mesure de l’épaisseur d’un nucléotide
Détermination à partir de modèles moléculaires de l’épaisseur d’une paire de nucléotide,
à partir de mesures réalisées sur des modèles moléculaires (Sources des données Protein Data Bank ou Libmol et visualisateur Libmol).
2. Détermination de la longueur de l’ADN présent dans une cellule.
Détermination à partir des bases de données du nombre de paires de nucléotides de l’information génétique,
à partir de l'exploitation de bases de données de séquences génétiques (Source des données NBCI genome ou genome data viewer ).
3. Calcul de la quantité totale d’ADN dans l’organisme en fonction du nombre de cellule.
Détermination du nombre de cellules d’un organisme,
à partir d'une base donnée cellulaire (Source des données Human cell tree map ).